Атом — это драмеди о научной борьбе и личных жертвах, которые её сопровождают, погружая зрителя в атмосферу 1940-х годов, когда холодная война не ограничивалась только международными конфликтами, но и стремлением к первенству в науке.

История, которая разворачивается в этой драмеди, передает не только личные переживания героев, но и отголоски социальных изменений, сопровождающих изменения в жизни города. Всё начинается с того, что Валя, решив уйти от Геннадия Хадякова после ссоры, уезжает с Патриков в Санкт-Петербург, отчаянно желая отдалиться от его навязчивого присутствия.